
ASP.NET Web API快速入門介紹
自2018年12月1日起,NCBI提供了API密鑰,以提供對電子公用事業的更高級別的支持訪問。如果沒有API密鑰,任何站點(IP地址)每秒向E-utilities發送超過3個請求將收到錯誤消息。通過包含API密鑰,默認情況下,站點每秒最多可以發布10個請求。更高的價格可根據要求提供(vog.hin.mln.ibcn@seitilitue)。用戶現在可以從其NCBI帳戶的設置頁面獲取API密鑰(要創建帳戶,請訪問http://www.ncbi.nlm.nih.gov/account/)。創建密鑰后,用戶應通過將其分配給API_key參數,將其包含在每個E-utility請求中。
Example request including an API key:
esummary.fcgi?db=pubmed&id=123456&api_key=ABCDE12345
Example error message if rates are exceeded:
{"error":"API rate limit exceeded","count":"11"}
每個NCBI帳戶只允許一個API密鑰;但是,用戶可以隨時請求新密鑰。此類請求將使與該NCBI帳戶相關聯的任何現有API密鑰無效。
輸入:文本查詢
匯總輸出:XML文檔摘要
EFetch輸出:記錄的數據記錄(例如摘要、FASTA)
use LWP::Simple;
# Download PubMed records that are indexed in MeSH for both asthma and
# leukotrienes and were also published in 2009.
$db = 'pubmed';
$query = 'asthma[mesh]+AND+leukotrienes[mesh]+AND+2009[pdat]';
#assemble the esearch URL
$base = 'https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/';
$url = $base . "esearch.fcgi?db=$db&term=$query&usehistory=y";
#post the esearch URL
$output = get($url);
#parse WebEnv and QueryKey
$web = $1 if ($output =~ /<WebEnv>(\S+)<\/WebEnv>/);
$key = $1 if ($output =~ /<QueryKey>(\d+)<\/QueryKey>/);
### include this code for ESearch-ESummary
#assemble the esummary URL
$url = $base . "esummary.fcgi?db=$db&query_key=$key&WebEnv=$web";
#post the esummary URL
$docsums = get($url);
print "$docsums";
### include this code for ESearch-EFetch
#assemble the efetch URL
$url = $base . "efetch.fcgi?db=$db&query_key=$key&WebEnv=$web";
$url .= "&rettype=abstract&retmode=text";
#post the efetch URL
$data = get($url);
print "$data";
Q:如何找到PubMed API
A:冪簡集成是國內領先的API集成管理平臺,專注于為開發者提供全面、高效、易用的API集成解決方案。冪簡API平臺可以通過以下兩種方式找到所需API:通過關鍵詞搜索API(例如,輸入’PubMed API‘這類品類詞,更容易找到結果)、或者從API hub分類頁進入尋找。
Q:如何搜索PubMed?
A:
Q:我檢索了太多引用。如何集中搜索?
A:要限制搜索結果的數量:
Q:我檢索的引文太少了。如何擴大搜索范圍?
A:
Q:查找特定引文
A:將文章標題粘貼到搜索框中,或在搜索框中輸入引文詳細信息,如作者,期刊名稱和文章發表的年份,PubMed引文傳感器將自動分析您的引文信息查詢,以返回正確的引文。引文傳感器采用了模糊匹配算法,即使搜索包含錯誤的術語,也會檢索到最佳匹配。不需要使用字段標記或布爾運算符。
Q:按作者搜索
A:在搜索框中輸入作者的姓氏和首字母(不帶標點符號),然后單擊“搜索”。
如果您只知道作者的姓氏,請使用作者搜索字段標記[Au],例如,布羅迪[Au]。
使用姓氏+首字母格式輸入的姓名(例如,smith ja)或全名格式(john a smith),并且如果在PubMed中存在,則不作為作者和合作者進行檢索。
按自然順序或倒序輸入完整的作者姓名,例如,julia s wong或wong julia s。
提供AI大模型API的服務商除了PubMed API,還有其他替代服務商也提供類似api服務,例如:
云數互聯 API開放平臺、uniprot API開放平臺、nudgify API開放平臺
更多競品可以在冪簡集成開放平臺中找到。
Q:PubMed API這個密鑰還適用于哪些api?
本文“如何獲取PubMed API開放平臺訪問密鑰分步指南”為科研工作者與開發者們提供了一份詳盡、實用的操作手冊,全面而清晰地闡述了獲取PubMed API訪問密鑰的全過程。從在PubMed API開放平臺注冊賬號開始,經過開發者身份認證,直至最終成功獲取API訪問密鑰,每一步操作都配以詳盡的說明和細致的指導,確保讀者能夠輕松、準確地完成整個流程。
本文還特別強調了獲取訪問密鑰后,進行API可用性測試的重要性。通過測試,可以確保PubMed API能夠順利集成到科研應用或數據分析系統中,并發揮出最佳效果,這對于提升科研效率、加速成果轉化具有重要意義。這份指南為科研工作者與開發者們提供了一個全面、詳盡且實用的指導,幫助他們順利獲取PubMed API訪問密鑰,并將這一強大的生物醫學信息檢索與分析能力有效地集成到應用中,從而為生物醫學研究與臨床實踐提供更加精準、高效的數據支持。